农村自建房的查封程序如下：
由有权机关（如法院）根据相关法律规定及案件情况提出查封申请。例如，在涉及债务纠纷案件中，债权人申请法院查封债务人的宅基地房，需要提供充分的证据和合理的事由。
相关部门（如土地管理部门、房屋管理部门等）对查封申请进行审查。主要审查查封是否符合法定情形，包括是否存在合法有效的法律依据，如生效的裁判文书等。
如果审查通过，将对宅基地房进行查封。这通常包括在相关登记部门进行查封登记，限制房屋的转让、抵押等处置行为，并且会在房屋所在地张贴查封公告，向当事人及社会公示该房屋已被查封的事实。
在查封过程中，需要遵循宅基地相关法律法规规定，保障宅基地使用人的基本居住权益等特殊情况。例如，如果农村自建房是被执行人及其赡养亲属生活必需品，法院可能不会采取拍卖等强制执行措施。
农村房子查封的法律依据主要体现在《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》中。该规定明确指出，人民法院可以查封、扣押、冻结被执行人占有的动产、登记在被执行人名下的不动产以及特定动产和其他财产权。
对于未登记的建筑物和土地使用权，法院将依据土地使用权的审批文件和其他相关证据来确定权属。在查封之前，法院需要向相关部门查询宅基地使用权权属登记，核实使用情况，并调取相关证明材料。
法院在查封过程中会通知相关各方，并公告查封事项，确保程序的合法性和效力。当事人在收到法院的通知后，应及时配合法院的调查和解决工作，同时可以寻求法律援助，以维护自身权益。
农村自建房被法院查封后，其处理方式将根据具体情况而定。如果房屋并非被执行人生活所必需，法院可能会选择对其进行拍卖处理，以偿还债务。但在拍卖过程中，法院需确保为被执行人和其直系亲属留下足够的居住空间，以满足其基本生活需求。
总结：
农村自建房的查封需要遵循一定的法律程序，包括申请、审查、执行查封等步骤，并且需要考虑到被执行人的基本居住权益。法院在查封过程中会严格按照法律规定进行，确保程序的合法性和效力。
