监狱内部通常设有多个部门，这些部门根据各自的职能负责监狱的日常管理和运营。以下是监狱内常见的部门及其职责：
监狱长
政委
副监狱长
副政委
工会主席
政治处主任
总工程师（有的监狱）
监区（各业务、职能科室）级职位：
监区长（科长）
政治教导员
副监区长（副科长）
副教导员
分监区（中队）级职位：
分监区长（股长）
政治指导员
副分监区长（副股长）
副指导员
各科室：
狱政管理科
刑罚执行科
教育科
劳动改造科
行政后勤科
监内医院
侦查科
生活卫生科
医务科
监狱级设党委，职位有党委书记、副书记、委员若干
监区（科）设党的支部，职位有支部书记、副书记、支部委员若干
监狱党委办
监狱办公室
监狱工会
监狱纪委
政治处
企管办
调度室
财务科
审计科
劳资科
生产科
供应科
销售科
行政科
